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一般來說影響消毒劑消毒效果的因素有以下幾個：
1、消毒劑的濃度:殺滅微生物的基本條件,包括消毒強(qiáng)度和時間兩方面,消毒強(qiáng)度在化學(xué)消毒時是指消毒劑使用濃度，消毒效果與消毒劑濃度和時間成正比。
2、微生物污染的種類和數(shù)量：生物的種類不同,對其消毒的效果自然不同，另外微生物數(shù)量的多少也會影響消毒效果。
3、溫度的影響：一般來說，溫度越高效果越好。
4、相對濕度：消毒環(huán)境相對濕度對氣體消毒和熏蒸消毒的影響十分明顯,濕度過高或過低都會影響消毒效果。二氧化氯在相對濕度50—70%殺菌效果較好。
5、酸堿度（PH值）：一方面PH值對消毒劑本身的影響是會降低或提高消毒劑的活性；另一方面PH值對微生物的影響是二氧化氯在酸性環(huán)境下殺菌效果較好。
6、有機(jī)物質(zhì)：消毒環(huán)境中的有機(jī)物質(zhì)往往能抑制或減弱消毒因子的殺菌能力,一方面有機(jī)物包圍在微生物周圍,對微生物起到保護(hù)作用，阻礙消毒因子的穿透；另一方面在化學(xué)消毒劑中,有機(jī)物本身也能通過化學(xué)反應(yīng)消耗一部分化學(xué)消毒劑。各種消毒劑受有機(jī)物的影響不盡相同，二氧化氯受有機(jī)物影響較小。
7、拮抗物質(zhì)：對于化學(xué)消毒方法,要注意拮抗物質(zhì)的中和與干擾。如酸性或堿性的消毒劑會被堿性或酸性的物質(zhì)所中和，減弱其消毒作用。
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